Kabupaten Halmahera Selatan yang tebagi dalam 30 (tiga puluh) kecamatan, yaitu :
- Kecamatan Obi Selatan
- Kecamatan Obi
- Kecamatan Obi Barat
- Kecamatan Obi Timur
- Kecamatan Obi Utara
- Kecamatan Bacan
- Kecamatan Mandioli Selatan
- Kecamatan Mandioli Utara
- Kecamatan Bacan Selatan
- Kepulauan Batang Lomang
- Kecamatan Bacan Timur
- Kecamatan Bacan Timur Selatan
- Kecamatan Bacan Timur Tengah
- Kecamatan Bacan Barat
- Kecamatan Kasiruta Barat
- Kecamatan Kasiruta Timur
- Kecamatan Bacan Barat Utara
- Kecamatan Kayoa
- Kecamatan Kayoa Barat
- Kecamatan Kayoa Selatan
- Kecamatan Kayoa Utara
- Kecamatan Pulau Makian
- Kecamatan Makian Barat
- Kecamatan Gane Barat
- Kecamatan Gane Barat Selatan
- Kecamatan Gane Barat Utara
- Kecamatan Kepulauan Joronga
- Kecamatan Gane Timur
- Kecamatan Gane Timur Tengah
- Kecamatan Gane Timur Selatan
Kabupaten Kepulauan Sula yang meliputi 12 (dua belas) Kecamatan, yaitu :
- Kecamatan Sanana Ibu Kota Sanana
- Kecamatan Sanana Utara Ibu Kota Pohea
- Kecamatan Sulabesi Tengah Ibu Kota Waiboga
- Kecamatan Sulabesi Timur Ibu Kota Baleha
- Kecamatan Sulabesi Barat Ibu Kota Kabau
- Kecamatan Sulabesi Selatan Ibu Kota Fuata
- Kecamatan Mangole Tengah Ibu Kota Mangole
- Kecamatan Mangole Timur Ibu Kota Waitina
- Kecamatan Mangole Utara Ibu Kota Falabisahaya
- Kecamatan Mangole Selatan Ibu Kota Buya
- Kecamatan Mangole Utara Timur Ibu Kota Waisakai
- Kecamatan Mangole Barat Ibu Kota Dofa
Kabupaten Taliabu yang meliputi 8 (delapan) Kecamatan, yaitu :
- Kecamatan Taliabu Barat Ibu Kota Bobong
- Kecamatan Taliabu Utara Ibu Kota Gela
- Kecamatan Taliabu Selatan Ibu Kota Pancado
- Kecamatan Taliabu Timur Ibu Kota Samuya
- Kecamatan Taliabu Barat Laut Ibu Kota Ngele
- Kecamatan Taliabu Timut Selatan Ibu Kota Losseng
- Kecamatan Lede Ibu Kota Lede
- Kecamatan Tabona Ibu Kota Tabona